Fue fundada el 9 de abril de 1822 por don Bernardino Rivadavia, ministro del gobierno de Martín Rodríguez, constituyéndose en una de las primeras del mundo.
Inicialmente se ocupaba de aspectos médicos, sociológicos, epidemiológicos, psicológicos, farmacológicos, alimentarios y geográficos. Actualmente, a través del Instituto de Investigaciones Epidemiológicas se cubren temas vinculados con la Geografía.
Acredita un reconocido prestigio dentro de las veintidós academias nacionales que, individualmente y en conjunto, vienen cumpliendo una labor de excelencia al servicio de la sociedad.
La Academia Nacional de Geografía viene incorporando, durante su trayectoria institucional, a distinguidos profesionales de la Medicina que han contribuido al desarrollo de los estudios geográficos. No dejamos de recordar entre ellos a Joaquín Frengüelli y Alfredo Castellanos.